Llegada a categoría nacional y ascenso a 2ª División

En 1943 el CD Cacereño consigue arrancar por primera vez en categoría nacional al instaurarse nuevamente la 3ª División, que había sido suprimida tras la temporada 40-41. En su primera temporada en esta categoría logra quedar campeón en el grupo VI, grupo en el que tuvo como rivales a Badajoz, Toledo, Salamanca, Ferroviaria, SD. Emeritense, SD. Alcalá, Manchego, Trujillo e Imperio Madrid.

El CD Cacereño cayó eliminado en la liguilla de ascenso de donde salían los equipos que ascendían a 2ª División y sus rivales en esta fase fueron Logroñés, Ferrol y Racing de Santander, que fue el que logró el ascenso. Así quedó la liguilla de ascenso:

Después llegaron unas temporadas irregulares en 3ª División, llegando incluso a estar cerca de los puestos de promoción de descenso en 1950. Fue al inicio de esta temporada, la 49-50, cuando se disputó el primer partido en la Ciudad Deportiva Sindical “José Sanz Catalán”, nombre que tomó de su iniciador e impulsor. El 2 de Octubre de 1949 se inauguraba el campo de fútbol enfrentándose el CD Cacereño en partido de Liga al Almería CF, que terminó con el marcador de 1-0 para los locales con gol de Contreras. Abandonaba así el CD Cacereño el viejo campo de Cabezarrubia para trasladarse a unas instalaciones más modernas y confortables. Dentro del complejo existían también piscinas, canchas para varios deportes, frontón, hípica y gimnasio. De esta época destaca un jugador por encima de todos, Perete, considerado por los muchos que lo vieron jugar, el mejor jugador de la historia del Cacereño. Era un interior de juego fino, toque preciso y una clase excepcional, especialista en lanzar faltas al borde del área. Llegó procedente del Sabadell y afirmaban los que lo vieron jugar que hubiera llegado a las más altas cotas de no ser por su insuficiencia bronquial.

En la temporada 1950-51 el CD Cacereño logra formar un gran equipo que consigue hacerse con el campeonato llegando al final con un punto más que el Deportivo Guadalajara. El CD Cacereño juega la liguilla de ascenso y no consigue el ansiado ascenso a 2ª División por la diferencia de goles con los otros equipos. El resultado final de esa liguilla fue el siguiente:

Formación inicial del CD Cacereño en un partido de la temporada 1950-51

La siguiente temporada el CD Cacereño quedó encuadrado en el grupo IV y volvió a dominar en el campeonato liguero frente a equipos de gran categoría, resultando finalmente campeón. La entonces recién estrenada Ciudad Deportiva, fue testigo de excepción del título. Faltaba saber qué resolución iba a tomar la Federación Española de Fútbol con respecto a los ascensos. Esta vez se rumoreaba insistentemente que los campeones subirían automáticamente a Segunda División, como así fue. El CD Cacereño lograba así alcanzar la categoría de plata del fútbol nacional por primera y, a la postre, última ocasión en su larga historia.